南校区图书馆落成于1986年，馆舍面积2580平米，目前已使用23年，面对陈旧狭小的馆舍和堆积如山的图书，如何发挥其最大的综合效能，真正适应学校专业布局结构调整的需要，充分满足农业科技学院和动物科技学院师生对文献资料的渴求，是摆在我们面前的头等大事。为此，我们把总馆搬迁作为对分馆发展的一个有利契机，制定了“按学科专业来整合文献，建立专业馆藏体系”的资源整合原则。
具体操作是：将各部室文献资源按学科专业进行重组、调配和整合。例如：图书、期刊、电子读物等等，使南校区分馆真正成为二级学院所在地的专业馆。从11月份开始，三层馆舍结构大调整，安装新架，拆换旧架，数万册文献资料开始重新布局，一支近二分之一戴“老花镜”工作的团队，克服了搬迁任务重、空间小、大规模倒架等诸多困难，仅用了25天的时间完成了从大规模搬迁到数万册书精细排架及数百包新书上架的艰巨任务。
整合后南校区图书馆的格局为：一层：借书处馆藏内容为社会科学（A-----K）类，自然科学（N----P）(T----Z)(TS除外)类；过刊室兼文检教研室二层：农科文献借阅处馆藏内容为S----S7(农学、园艺、林业)、TS（食品科学）；社科阅览室三层：动科文献借阅处馆藏内容为S8---S9(畜牧、动物医学等)Q（生物科学）、R (医药卫生)；电子阅览室；工具书库。
资源整合后的南校区图书馆凸显了专业图书馆的特点，形成了书刊一体、师生一体、借阅一体的格局，布局的变化带来了服务模式的转变。从服务手段上包括“读者签到”在内的每一个业务环节将在ILasII系统下操作，彻底改变传统的服务模式，拓展服务范围，延长服务时间，提升服务形象，为读者提供真正意义上的“一站式”服务。